Mangaan speelt een belangrijke rol in veel stofwisselingsprocessen van het menselijk lichaam als activator van enzymen en als onderdeel van enzymen: talrijk mangaan-geactiveerde enzymen spelen een belangrijke rol in koolhydraten, aminozuren en cholesterol metabolisme, evenals in gluconeogenese - de productie van glucose van niet-koolhydraatprecursoren - en in ureum metabolisme - belangrijk voor de ontgifting of ammonia. Voorts mangaan is een geprefereerde cofactor van het enzym glycosyltransferase, dat nodig is voor de productie van proteoglycanen, die van groot belang zijn voor de vorming van kraakbeen en bot - en dus voor hun volksgezondheidMangaan is een bestanddeel van mangaansuperoxide-dismutase (MnSD), de belangrijkste anti-oxidant enzym in de mitochondria, de energiecentrales van de cel. Sinds meer dan 90% van de zuurstof nodig in cellen wordt verbruikt in de mitochondriaDit verklaart het bijzondere belang van dit enzym: het zet de superoxide radicalen die tijdens oxidatie worden gevormd om in waterstof peroxide, dat wordt gereduceerd tot water bij anderen enzymen en dus afgevoerd. Mangaan is van belang voor huid genezing en regeneratie: het is nodig voor de aanmaak van het aminozuur proline, dat op zijn beurt weer belangrijk is collageen formatie in huid cellen.
