De volgende zijn de belangrijkste ziekten of complicaties waaraan kan worden bijgedragen door Coxsackie-virusinfecties:
Endocriene, voedings- en stofwisselingsziekten (E00-E90).
- Suikerziekte type 1
- Thyroiditis (ontsteking van de schildklier)
Huid en onderhuids (L00-L99)
- Verworven onychodystrofie (pathologische nagelgroei) van beide grote teennagels met onychomadesis (proximale loslating van de nagelplaat van het nagelbed) en leukonychie (witte vlekken op de nagels) secundair aan Coxsackie A6-geassocieerde hand-mond-en-klauwzeer (late complicatie )
Cardiovasculair systeem (I00-I99).
- myocardiet (ontsteking van de hart- spier).
- Pericarditis (ontsteking van het hartzakje)
Psyche - zenuwstelsel (F00-F99; G00-G99)
- Hersenvliesontsteking (meningitis).
- Meningoencefalitis (gecombineerd ontsteking van de hersenen (encefalitis) en hersenvliezen (hersenvliesontsteking)).
- Verlamming
