De volgende symptomen en klachten kunnen wijzen op de ziekte van Whipple:
- Gewichtsverlies
- Enteropathische artritis (oligoartritis / optreden van gewrichtsontsteking (artritis) in minder dan 5 gewrichten) / spondyloartropathie / sacroiliitis (ontsteking van sacro-iliacaal gewricht tussen sacrum en ilium); meest voorkomende eerste symptoom: 18%; kan tot 10 jaar voorafgaan aan darmsymptomen ('die de darm aantasten')!)
- Synovialitis (synoviale ontsteking).
- Lymfadenopathie (weefselvocht knooppuntvergroting).
- Buikpijn (buikpijn)
- Diarree (diarree)
- Fever
- Neurologische symptomatologie met geheugenverlies (geheugen verlies), dementie, blikverlamming, epilepsie (epileptische aanvallen), loopstoornissen, verstoord slaap-waakritme, polydipsie (abnormaal toegenomen water inname; meer dan 4 liter vochtinname per dag).
- pleuris (pleuritis), mogelijk borstvliesuitstroming (abnormale ophoping van vocht in de borstholte, dat wil zeggen tussen de binnenwand van de borst en de longen).
- pericarditis (ontsteking van de hartzakje).
- Stoornissen in huid pigmentatie, niet gespecificeerd.
- Bloedarmoede (bloedarmoede)
- Uveitis - ontsteking van het middelste oog huid.