De volgende zijn de belangrijkste ziekten of complicaties waaraan kan worden bijgedragen door de ziekte van Whipple:
Ogen en oogaanhangsels (H00-H59).
Cardiovasculair systeem (I00-I99)
- Endocarditis (endocardiale ontsteking; tweede meest voorkomende locatie).
- myocardiet (ontsteking van de hart- spier).
- pericarditis (ontsteking van de hartzakje) met hartklepinsufficiëntie.
Musculoskeletaal systeem en bindweefsel (M00-M99).
- polyartritis (ontsteking van multiple gewrichten).
- Synovialitis (ontsteking van het synoviale membraan)
Psyche - zenuwstelsel (F00-F99; G00-G99)
- Amnesie (geheugenverlies)
- Ataxie (loopstoornis)
- Verlamming van de blik
- Dementia
- Epilepsie (toevallen)
- Verstoord slaap-waakritme
Symptomen en abnormale klinische bevindingen en laboratoriumbevindingen, niet elders geclassificeerd (R00-R99).
- pleuris (pleuritis).
